大唐贞观初年，唐太宗李世民(贺刚 饰)即位未久，此时尚非王朝鼎盛时期。辽阔疆域尚未从连年征战的损耗中恢复生机，随即又遭遇一场范围极广的严寒雪灾，致使数以万计的流离百姓向都城长安聚集。值此之际，玄武门事变中殒命的隐太子残余势力借机生乱，干扰朝廷新政推行，利用多种古代杀人技法，屠戮数万民众，从而为贞观新朝笼罩上一层动荡阴影。长安城门附近尸横遍野，行凶者完成杀戮后自刎身亡。尉迟方(任天野 饰)将尸体翻转查验，辨认出此人乃是神刀崔元启将军，其手掌上留有李淳风(陈浩民 饰)的血印。崔元启犯案之事在城中迅速传开，其临终前曾有诡异琴音响起。李世民查明案件后，确认行凶者为已故的崔元启，民间随之流传出各类鬼神之说。李淳风意识到自身面临麻烦，他素来精通天文地理之学，平日居于随意楼中，尉迟方探得其住所后前往查访，崔元启尸身杀人之事令众人困惑不解。李淳风返回店铺后默然坐于尉迟方身侧，此时遇见前来滋事的钟馗，钟馗不问缘由便砸毁随意楼的桌椅与招牌。钟馗饮用店内物品后口吐白沫倒地，李淳风命人将其拖出店外，尉迟方则趁机将李淳风拘捕。李淳风通过骨骼形貌辨识出来者实为尉迟恭，其言辞令尉迟方信服，尉迟方只得将其释放，李淳风斥责其为昏聩官吏，尉迟方复又将其带走。郡主改扮为公子装束来到长安街市，李淳风察验崔元启手掌所留自己姓名，断定字迹并非崔元启亲笔所书。谢应龙见到郡主出现在崔元启尸身旁侧，李淳风在崔元启掌心绘制符印，崔元启手上姓名痕迹随之消失，尉迟方因此无法对其定罪。郡主发现崔元启掌中姓名已被消除，推测行事者即为李淳风，她决定暂时保持观望。谢应龙前往青楼寻觅柳五娘，要求其如实供述所知内情。
此时长安城内人心惶惶，《高瞻日报》刊载的案情记述更添纷扰。钟国柱与钟太婆桂森在宅中议论此事，孙玛利则向邻里转述夜间听闻的诡异琴声。思翰在书院中与同窗探讨尸身行动的玄理，田凯于酒肆内听闻游侠讲述崔元启生前轶事。李淳风重返随意楼后闭门不出，尉迟方派差役日夜监视其动向。郡主暗中遣人调查崔元启生前交往脉络，发现其与隐太子旧部曾有隐秘往来。谢应龙对柳五娘施加压力，要求其交代崔元启遇害前所见所闻。长安府衙内，尉迟方将多方线索汇总呈报，李世民责令限期查明真相。李淳风于楼阁顶层观测星象变化，察觉天象异动与城中命案存在微妙关联。钟馗苏醒后记忆模糊，无法说清当日随意楼事发经过。尉迟方再度提审李淳风，要求其解释血印来历及符印原理。郡主伪装成香客前往道观探听消息，偶遇同样在查案的谢应龙。各方势力在长安城中交织活动，形成错综复杂的调查网络。李世民在宫中听取案情进展，指示需破除迷信传言以安定民心。李淳风向尉迟方演示阴阳五行推演之法，说明尸身行动的可能原理。钟国柱与钟太婆桂森提供崔元启生前购置物件的线索，孙玛利则回忆起曾见崔元启与神秘人物会面。思翰从古籍中找到类似案例记载，田凯通过江湖渠道获得隐太子残余势力的活动情报。案件调查逐渐深入，牵扯出更多隐藏在表象之下的脉络。尉迟方整合各方信息后，开始重新梳理案件时间线与人物关系。李淳风配合官府查验多具受害者遗体，发现均存在特定手法痕迹。郡主将暗中收集的证物转交谢应龙，助其突破柳五娘心理防线。长安城的夜幕下，真相正在层层迷雾中逐渐显露轮廓。